Deixar de emitir uma nota pode acarretar alguns problemas. Considerando que a nota é o que gera imposto.
Se não há nota, não existe imposto e isso pode fazer com que a empresa não contribua corretamente com esses tributos e isso pode ser visto como sonegação de impostos.
É extremamente importante lembrar que a Receita Federal pode solicitar a qualquer momento dentro do prazo de 5 anos, as notas emitidas por sua empresa para verificação.
Se precisar de ajuda para emitir notas fiscais na sua empresa, entre em contato conosco!